O NECOOP desenvolve pesquisa e extensão junto a assentamentos da reforma agrária, comunidades quilombolas e povos indígenas na região da Fronteira Sul. O Núcleo integra o desenvolvimento do Manual de Acompanhamento a Empresas Sociais dos Assentamentos de Reforma Agrária (MAE), em parceria com o LECERA/UFSC, o Instituto Conscientiae e a Fundação Mundukide — ferramenta metodológica originalmente desenvolvida pela Confederação das Cooperativas de Reforma Agrária do Brasil (CONCRAB).
